商南地处秦岭东段南麓，属长江流域汉江水系丹江中游地区。坐标介于东经110°24'-111°01'之间，北纬33°06'-33°44'之间。北依蟒岭与河南省卢氏县接壤；南障郧西大梁与湖北省郧县、郧西县为邻；东界界牌与河南省西峡县相望；西至冀家湾与本省丹凤县毗连。南北长72公里，东西宽58公里，总面积2300.74平方公里。 商南县是一块结构复杂，以低山、丘陵为主体的山区。境内地势西南部和北部较高，东南部和中部较低，千米以下的低山、丘陵占总面积的77%。丹江自西向东横贯县境中部，把全县分为丹南、丹北两部分。岭谷相间，地势起伏，相差悬殊，相对高差最大值在1840.6米。 由于复杂的地质构造、外应力的影响和人类活动等原因，境内地形复杂，差异较大，大致以丹江为界，丹北是蟒岭的东延部分，山势多西北向东南走向，地势由高趋低，主要由石英片岩、石英岩等变质杂岩组成，山体浑圆，冈峦起伏、尤其是西界公路以南地区，山体排列松散，河谷开阔，但植被较差。丹江以南是由结晶灰岩、板岩、千枚岩、石英片岩、大理石岩、变砂岩组成的新开岭山地，山势多由西向东，地势西高东低，山形陡峭，河谷深切，多溶洞山泉，山上植被葱郁。 商南地处北亚热带与暖温带的过度地带，独特的地理位置造就着 商南独特的气候、植被、土壤资源。商南四季分明，气候宜人，自然风光旖旎，有长江三级支流丹江的过境，使这里蕴藏有丰富的水力资源。